Les rapports MTD sont divisés en 6 chapitres: le premier chapitre introduit le concept de MTD; le chapitre 2 explique le cadre socio-économique et environnemental et législatif du secteur; le chapitre 3 est une description du processus; le chapitre 4 regroupe les techniques écologiques disponibles; le chapitre 5 est une sélection des Meilleures Techniques Disponibles; et, enfin, le chapitre 6 répertorie les recommandations des experts.
Des représentants du SSSUP (responsable du GTT Textile) et VITO (responsable du GTT des produits laitiers) ont organisé, avec la collaboration de tous les PMPs, les réunions des GTTs dans chaque pays. Les principaux objectifs des réunions du groupe de travail technique étaient de discuter du contenu des chapitres 2 et 3, d'identifier des lacunes possibles dans les données, décider la structure pour le chapitre 4 et décrire la méthodologie afin d'évaluer les candidats MTD à appliquer au chapitre 5.
Les rapports MTD sont le principal aboutissement du projet et il est prévu de les publier en 2013.